MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Borrelia burgdorferi B31 plasmid cp32-4

Total Repeats: 682

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000950	GT	3	6	66	71	0 %	50 %	50 %	0 %	11497179
2	NC_000950	AAAAC	2	10	81	90	80 %	0 %	0 %	20 %	11497179
3	NC_000950	T	6	6	135	140	0 %	100 %	0 %	0 %	11497179
4	NC_000950	AGA	2	6	164	169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497179
5	NC_000950	TGC	2	6	200	205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	11497179
6	NC_000950	TAT	2	6	272	277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497179
7	NC_000950	AAC	2	6	343	348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497179
8	NC_000950	CAA	2	6	449	454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497179
9	NC_000950	AT	3	6	504	509	50 %	50 %	0 %	0 %	11497179
10	NC_000950	ATTT	3	12	573	584	25 %	75 %	0 %	0 %	11497179
11	NC_000950	TAGAAA	2	12	598	609	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	11497179
12	NC_000950	T	6	6	629	634	0 %	100 %	0 %	0 %	11497179
13	NC_000950	CAA	2	6	685	690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497179
14	NC_000950	CTT	2	6	691	696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11497179
15	NC_000950	TAA	2	6	716	721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497179
16	NC_000950	TCT	2	6	744	749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11497179
17	NC_000950	T	6	6	749	754	0 %	100 %	0 %	0 %	11497179
18	NC_000950	AAT	2	6	855	860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497179
19	NC_000950	TTA	2	6	904	909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497179
20	NC_000950	AGG	2	6	931	936	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	11497179
21	NC_000950	ATTA	2	8	944	951	50 %	50 %	0 %	0 %	11497179
22	NC_000950	ATG	2	6	1024	1029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497179
23	NC_000950	ATT	2	6	1048	1053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497179
24	NC_000950	T	6	6	1058	1063	0 %	100 %	0 %	0 %	11497179
25	NC_000950	GAG	2	6	1248	1253	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	11497179
26	NC_000950	ATT	2	6	1274	1279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497179
27	NC_000950	AGA	2	6	2039	2044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497180
28	NC_000950	A	6	6	2052	2057	100 %	0 %	0 %	0 %	11497180
29	NC_000950	TAG	2	6	2174	2179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497180
30	NC_000950	TAC	2	6	2258	2263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11497180
31	NC_000950	TGG	3	9	2282	2290	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	11497180
32	NC_000950	TGGCA	2	10	2333	2342	20 %	20 %	40 %	20 %	11497180
33	NC_000950	AAATGG	2	12	2393	2404	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	11497180
34	NC_000950	TGCT	2	8	2533	2540	0 %	50 %	25 %	25 %	11497180
35	NC_000950	AATTA	2	10	2571	2580	60 %	40 %	0 %	0 %	11497180
36	NC_000950	TGA	2	6	2621	2626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497181
37	NC_000950	GAA	2	6	2697	2702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497181
38	NC_000950	A	6	6	2766	2771	100 %	0 %	0 %	0 %	11497181
39	NC_000950	TAG	2	6	2810	2815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497181
40	NC_000950	GTT	2	6	2824	2829	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11497181
41	NC_000950	AGA	2	6	2894	2899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497181
42	NC_000950	AG	3	6	2960	2965	50 %	0 %	50 %	0 %	11497181
43	NC_000950	TA	3	6	2969	2974	50 %	50 %	0 %	0 %	11497181
44	NC_000950	CTGATA	2	12	2989	3000	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	11497181
45	NC_000950	ATGT	2	8	3019	3026	25 %	50 %	25 %	0 %	11497181
46	NC_000950	TAG	2	6	3032	3037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497181
47	NC_000950	GTAT	2	8	3044	3051	25 %	50 %	25 %	0 %	11497181
48	NC_000950	ATAA	2	8	3126	3133	75 %	25 %	0 %	0 %	11497181
49	NC_000950	TTA	2	6	3142	3147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497181
50	NC_000950	TGG	3	9	3155	3163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	11497181
51	NC_000950	CCA	2	6	3165	3170	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	11497181
52	NC_000950	TAAT	2	8	3175	3182	50 %	50 %	0 %	0 %	11497181
53	NC_000950	CT	3	6	3192	3197	0 %	50 %	0 %	50 %	11497181
54	NC_000950	CAAT	2	8	3208	3215	50 %	25 %	0 %	25 %	11497181
55	NC_000950	ATCAAG	2	12	3235	3246	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	11497181
56	NC_000950	TGG	2	6	3338	3343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	11497181
57	NC_000950	ATT	2	6	3393	3398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	364556467
58	NC_000950	AAGAG	2	10	3410	3419	60 %	0 %	40 %	0 %	364556467
59	NC_000950	T	6	6	3508	3513	0 %	100 %	0 %	0 %	364556467
60	NC_000950	ATC	2	6	3557	3562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	364556467
61	NC_000950	TGG	2	6	3654	3659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	364556467
62	NC_000950	GAT	2	6	3664	3669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	364556467
63	NC_000950	AAT	2	6	3733	3738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	364556467
64	NC_000950	TAG	2	6	3752	3757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	364556467
65	NC_000950	TAA	2	6	3798	3803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	364556467
66	NC_000950	CAC	2	6	3833	3838	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	364556467
67	NC_000950	T	7	7	3899	3905	0 %	100 %	0 %	0 %	364556467
68	NC_000950	GTAA	2	8	3937	3944	50 %	25 %	25 %	0 %	364556467
69	NC_000950	ATT	2	6	3978	3983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	364556461
70	NC_000950	TGA	2	6	3984	3989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	364556461
71	NC_000950	ATT	2	6	3992	3997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	364556461
72	NC_000950	TAA	2	6	4296	4301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	364556461
73	NC_000950	ACTT	2	8	4304	4311	25 %	50 %	0 %	25 %	364556461
74	NC_000950	TC	3	6	4316	4321	0 %	50 %	0 %	50 %	364556461
75	NC_000950	ATT	2	6	4348	4353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	364556461
76	NC_000950	TTA	2	6	4358	4363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	364556461
77	NC_000950	TTCAA	2	10	4389	4398	40 %	40 %	0 %	20 %	364556461
78	NC_000950	A	6	6	4407	4412	100 %	0 %	0 %	0 %	364556461
79	NC_000950	CTT	2	6	4444	4449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	364556461
80	NC_000950	AGA	2	6	4470	4475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	364556461
81	NC_000950	TAA	2	6	4488	4493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	364556461
82	NC_000950	A	6	6	4517	4522	100 %	0 %	0 %	0 %	364556461
83	NC_000950	ATG	2	6	4573	4578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	364556461
84	NC_000950	GCA	3	9	4624	4632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	364556461
85	NC_000950	GCA	2	6	4639	4644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	364556461
86	NC_000950	GGA	2	6	4662	4667	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	364556461
87	NC_000950	TAA	2	6	4695	4700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	364556461
88	NC_000950	AGA	2	6	4704	4709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	364556461
89	NC_000950	TTA	2	6	4775	4780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	364556461
90	NC_000950	TCAT	2	8	4851	4858	25 %	50 %	0 %	25 %	364556461
91	NC_000950	AGG	2	6	4875	4880	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	364556461
92	NC_000950	CTA	2	6	4889	4894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	364556461
93	NC_000950	A	7	7	4962	4968	100 %	0 %	0 %	0 %	11497154
94	NC_000950	GAA	3	9	4991	4999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497154
95	NC_000950	TTAC	2	8	5159	5166	25 %	50 %	0 %	25 %	11497154
96	NC_000950	GTT	2	6	5204	5209	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11497154
97	NC_000950	GAATTT	2	12	5213	5224	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	11497154
98	NC_000950	A	6	6	5234	5239	100 %	0 %	0 %	0 %	11497154
99	NC_000950	TGAACT	2	12	5251	5262	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	11497154
100	NC_000950	ATT	2	6	5265	5270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497154
101	NC_000950	TAG	2	6	5275	5280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497154
102	NC_000950	GAA	2	6	5291	5296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497154
103	NC_000950	G	6	6	5305	5310	0 %	0 %	100 %	0 %	11497154
104	NC_000950	TG	3	6	5390	5395	0 %	50 %	50 %	0 %	11497154
105	NC_000950	AATG	2	8	5406	5413	50 %	25 %	25 %	0 %	11497154
106	NC_000950	TGT	2	6	5499	5504	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	364556462
107	NC_000950	TTC	2	6	5520	5525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	364556462
108	NC_000950	AG	3	6	5531	5536	50 %	0 %	50 %	0 %	364556462
109	NC_000950	TTA	2	6	5573	5578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	364556462
110	NC_000950	TGG	2	6	5822	5827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	11497156
111	NC_000950	TAG	2	6	5903	5908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497156
112	NC_000950	AT	3	6	5924	5929	50 %	50 %	0 %	0 %	11497156
113	NC_000950	AAT	2	6	5931	5936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497156
114	NC_000950	TA	3	6	5940	5945	50 %	50 %	0 %	0 %	11497156
115	NC_000950	CTA	2	6	6024	6029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11497156
116	NC_000950	AAGT	2	8	6071	6078	50 %	25 %	25 %	0 %	11497156
117	NC_000950	GTA	2	6	6088	6093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497156
118	NC_000950	GCA	2	6	6099	6104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	11497156
119	NC_000950	TTG	2	6	6112	6117	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11497156
120	NC_000950	AAT	2	6	6239	6244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497157
121	NC_000950	ATC	2	6	6273	6278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11497157
122	NC_000950	GCT	2	6	6299	6304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	11497157
123	NC_000950	ATA	2	6	6314	6319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497157
124	NC_000950	AT	4	8	6416	6423	50 %	50 %	0 %	0 %	11497157
125	NC_000950	AT	3	6	6550	6555	50 %	50 %	0 %	0 %	11497157
126	NC_000950	TAA	2	6	6556	6561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497157
127	NC_000950	AGG	2	6	6696	6701	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	11497157
128	NC_000950	TAG	2	6	6761	6766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497183
129	NC_000950	ATT	2	6	6772	6777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497183
130	NC_000950	GCTA	2	8	6831	6838	25 %	25 %	25 %	25 %	11497183
131	NC_000950	TAA	2	6	6860	6865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497183
132	NC_000950	AATGGA	2	12	6900	6911	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	11497183
133	NC_000950	GAAAA	2	10	6925	6934	80 %	0 %	20 %	0 %	11497183
134	NC_000950	A	6	6	6931	6936	100 %	0 %	0 %	0 %	11497183
135	NC_000950	T	6	6	6962	6967	0 %	100 %	0 %	0 %	11497183
136	NC_000950	GAA	2	6	6978	6983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497183
137	NC_000950	A	6	6	7034	7039	100 %	0 %	0 %	0 %	11497183
138	NC_000950	AC	3	6	7058	7063	50 %	0 %	0 %	50 %	11497183
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